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破解细胞周期“质检员”的组装密码,天津医科大学刘立仁等团队揭示关键蛋白如何精准“上岗”
2026-06-11

Cullin-RING 泛素连接酶 4(CRL4)复合体依靠 DDB1-CUL4 结合因子(DCAFs)实现底物识别特异性,但各类 DCAF 分子结合衔接蛋白 DDB1 的分子机制尚未完全阐明。


2026年6月2日,天津医科大学刘立仁、中国科学院深圳先进技术研究院张华威共同通讯在Cell Reports(IF=8.1)在线发表题为DCAF8 binds DDB1 via an N-terminal helix-loop-helix motif to assemble CRL4 and promote cell cycle progression的研究论文。本研究解析了DCAF8与DDB1结合复合物的冷冻电镜结构(2.53Å),明确了CRL4DCAF8复合体组装及细胞周期运转的关键分子决定位点。


结构结果显示:DCAF8主要凭借N端螺旋‑环‑螺旋(HLH)基序结合DDB1,该基序嵌入DDB1的BPA、BPC结构域共同围成的保守疏水口袋。破坏二者结合界面会阻碍复合体组装、抑制CDC25A泛素化修饰,最终诱发细胞周期异常。


与之不同,DCAF8保守双DxR框结构域的氨基酸残基远离DDB1结合界面,对衔接蛋白的结合并非必需。综上,本研究阐明了CRL4泛素连接酶复合体中DCAF8独特的招募组装机制。


泛素‑蛋白酶体系统(UPS)是维持蛋白质组稳态的关键体系,而Cullin‑RING连接酶(CRLs)是数量最庞大的E3泛素连接酶家族。其中CRL4复合体由支架蛋白CUL4A/CUL4B、衔接蛋白DDB1、RING蛋白RBX1构成,由DDB1‑CUL4相关因子(DCAFs)决定底物识别特异性。


CRL4连接酶通过选择性底物泛素化,调控DNA复制、染色质重塑、DNA损伤修复及细胞周期进程等多种细胞生命活动。鉴于其重要生理功能,CRL4功能异常与多种疾病密切相关。


CRL4复合体的底物特异性由种类持续扩增的DCAF家族(底物受体)决定。目前已发现人类体内90余种候选DCAF蛋白,但仅少数蛋白有高分辨率结构数据,DCAF招募及CRL4组装的分子规律尚不完整。


已解析的多种DCAF‑DDB1复合体结构显示:多数DCAF依靠保守N端螺旋‑环‑螺旋(HLH)基序结合DDB1。该保守结合模式提示:结构各异的DCAF可依托统一骨架结合DDB1,组装成具备催化活性的CRL4连接酶。


DCAF8是功能关键的DCAF成员,参与细胞周期调控与多种靶蛋白稳定性维持。DCAF8介导细胞分裂周期蛋白25A(CDC25A)泛素化;CDC25A是调控S期启动与运转的关键磷酸酶,由此CRL4DCAF8通路关联细胞增殖与存活。


尽管DCAF8生理作用明确,但DCAF8结合DDB1、组装功能性CRL4复合体的分子基础仍不清晰。既往研究推测WD40结构域内保守双DxR框参与DDB1结合,但尚无直接结构学证据佐证该假说。


本研究解析人源DCAF8‑DDB1复合体近原子分辨率冷冻电镜(cryo‑EM)结构,明确二者互作的分子构象。结合结构解析、生化实验与细胞功能验证证实:DCAF8主要依靠N端HLH基序结合DDB1,既往报道的双DxR框并不直接参与二者结合。该HLH基序嵌入DDB1的BPA、BPC结构域形成的结合口袋,通过大量氢键与疏水相互作用稳固复合物。破坏该结合界面会阻碍CRL4DCAF8组装、抑制CDC25A泛素化,最终造成细胞周期紊乱。


综上,本研究阐明DCAF8发挥功能的结构与作用机制,为CRL4底物受体结合DDB1、调控泛素依赖性蛋白降解的保守规律提供理论依据。

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